[ 2024] 柯惠菁、胡心慈、鄭聖敏*（2023）。建構離島特殊教育支持系統之研究。教育科學研究期刊，68（3），1-34。

[ 2021] 鄭聖敏、柯惠菁、陳秀芬(2021)。逆風飛翔—大專身心障礙學生自我探索學習之旅，特殊教育研究學刊，46(3)，1-27。

[ 2015] 洪儷瑜、柯惠菁、曾瑞蓉、姚惠馨、高苑瑄、王宣惠(2015)。出席第二十一屆亞洲智能障礙聯盟會議紀要。特殊教育季刊，135，17-24。

[ 2015] 柯惠菁(2015)。大專校院教育階段身心障礙學生輔助科技服務品質之探討。特殊教育與輔助科技，13，23-28。

[ 2014] 鄭聖敏、陳秀芬、柯惠菁(2014)。雙重特殊需求學生多層次教學輔導之理念與作法。資優教育季刊，132，13-27。

[ 2013] Diane P. Bryant & Brian R. Bryant主講，柯惠菁翻譯整理(2013)。普通教育教師和特殊教育教師的合作教學—從介入反應的實務談起。特殊教育季刊，127，1-8。

[ 2013] 柯惠菁、陳奕君(2013)。行動載具應用於身心障礙者教育之初探。特殊教育與輔助科技，9，26-30。

[ 2013] 柯惠菁 (2013)。輔助科技在身心障礙學生的應用。學務通訊,880。

[ 2013] 柯惠菁 (2013)。互動視訊遊戲提升身心障礙學生學習成效之研究。雲嘉特教,17,29-37。

[ 2019] 范渝萍、林采裴、鄭聖敏、柯惠菁、潘正宸 (2019)。大專校院延長修業年限及休學規定對身心障礙學生就學影響與相關因應之研究。中華民國特殊教育學會第51屆年會暨學術研討會，台北，臺灣。

[ 2018] 黃柏華、柯惠菁、李依亭、張瓊文 (2018)。大專校院身心障礙學生生涯信念之探討─以六位國立臺灣師大資源教室服務學生為例。2018第二屆亞太地區融合教育國際研討會，台北，臺灣。2018/06/09~10。

[ 2018] 洪儷瑜、胡心慈、柯惠菁、王雅瑜 (2018)。臺灣偏鄉特殊教育現況與問題分析--以金馬離島地區為例。第二屆亞太地區融合教育國際研討會，台北，台灣。2018/06/09~10

[ 2015] 柯惠菁、范渝萍(2015年5月)。分析臺灣辦理融合教育相關議題的研習課程─以教材平台資料庫為例。第一屆亞太地區融合教育國際研討會發表之論文，臺北，臺灣。2015/05/29-2015/05/30

[ 2015] 柯惠菁、陳秀芬、張正芬、林迺超、陳奕君(2015年05月)。玩具總動員~從雙重特殊學生營隊探討身心障礙資賦優異學生的學習成效。第一屆亞太地區融合教育國際研討會發表之論文，臺北，臺灣。2017/05/28-2017/05/30

[ 2015] 張正芬、鄭聖敏、柯惠菁、陳秀芬(2015年12月)。雙重特殊需求學生多層次教學輔導模式初探(一)第二層次的教學輔導—以暑期營隊為例。2015特殊教育暨雙重殊異學術論文研討會發表之論文，臺北，臺灣。2017/12/12

[ 2011] 柯惠菁 (2011/11)。互動視訊遊戲對提升身心障礙學生科學學習成效之研究。99年度科學教育學門專題研究計畫成果討論會,高雄，臺灣。

[ 2011] Hui-Ching Ko(柯惠菁) (2011/11)。Embodied Interaction Video Games (EIVG) for Students with Disabilities。The conference of Teacher Education Division of Council for Exceptional Children,Austin, Texas。

[ 2010] 盧台華、鄭聖敏、柯惠菁、蘇芳柳、張俊彥、呂玉琴、羅珮華、任宗浩 (2010/12)。帶好每位學習不利學生的數理教育—在數學及自然與生活領域之教學中實現。國科會科教處98年度科學教育學門專題研究計畫成果討論會,臺東，臺灣。

[ 2009] 資訊科技知能在特殊需求學生之應用手冊(盧台華、柯惠菁、胡純、陳秀芬、鄭聖敏、蘇芳柳)

[ 2009] 資訊科技知能在特殊需求學生之應用手冊(盧台華、柯惠菁、胡純、陳秀芬、鄭聖敏、蘇芳柳)

[ 2009] 身心障礙者的輔助科技(柯惠菁)

年度	計畫名稱	主持人	擔任之工作	執行期程	補助/委託機構	備註
2016	臺北市105年度國民教育階段身心障礙資賦優異學生優勢才能教學輔導模式	潘裕豐	協同主持人	2016年04月 ~  2017年01月	臺北市政府	已結案
2015	臺北市104年度國民教育階段身心障礙資賦優異學生優勢才能教學輔導模式	張正芬、潘裕豐	協同主持人	2015年03月 ~  2015年12月	臺北市政府	已結案
2014	國民教育階段身心障礙資賦優異學生優勢才能教學輔導模式及國民中學學術性向資優鑑定實作評量試題研發及效度評估	張正芬	協同主持人	2014年04月 ~  2014年12月	台北市政府	已結案
2009	互動視訊遊戲對提升身心障礙學生科學學習成效之研究	柯惠菁	計畫主持人	2009年02月 ~  2010年07月	科技部	已結案